预后模型在脑胶质瘤疾病中的应用,预后模型即为评估相关疾病结局的模型,临床上常用来评估某一疾病的进展状况、患者生存时间以及发展到某一疾病阶段的概率,其评估因子及评估方法多样,包括放射组学、自噬相关基因、DNA甲基化、非编码RNA、选择性剪接、蛋白质二硫键异构酶(PDI)等,上述因素以单独或者联合的方式构建胶质瘤预后模型,临床特征常常结合在其他因素中。
1放射组学因素构建脑胶质瘤预后模型
放射组学是指从放射影像中提取高通量的定量特征,并建立图像特征与基因组模式以及临床结果相关评估模型的过程,许多放射组学模型被提出用于生存评估、复发评估等。Lao等通过多模态MRI图像中提取深度特征,提出了基于深度特征的放射组学模型来评估GBM患者的总体生存率,构建了放射组学列线图模型,并在一个独自的验证队列上进行了验证。
肿瘤浸润区域的无创性活体描绘和瘤体周围水肿早期复发的评估有助于局部靶向强化治疗,从而潜在地延缓肿瘤复发,延长患者生存期限。Rathore等通过瘤体周围水肿的放射组学特征建立评估术后GBM早期复发的概率,该模型表明MRI序列的多参数模式分析有助于估计瘤周水肿肿瘤复发的空间范围和模式,从而指导超全切除和/或术后强化放疗。
2自噬相关基因构建脑胶质瘤预后模型
自噬是一种溶酶体降解途径,对生存、分化、发育和体内多种平衡至关重要。自噬相关基因介导的溶酶体降解途径在细胞、组织和组织稳态中起到重要作用,包括清除危险物质、分化过程中的修复以及预防癌症中的基因组损伤。有研究表明自噬参与了脑胶质瘤的发生和发展。因此筛选新的自噬相关基因标志物和建立一个预后模型是必要的。
Wang等在美国癌症基因图谱数据库(TCGA)中筛选GBM和人自噬相关基因,并对其进行单变量和多变量Cox回归分析,选择神经调节蛋白1、整合素亚单位α3和微管结合蛋白1轻链3α基因建立预后风险评分模型,构建了包括自噬特征、年龄、药物治疗、放疗和IDH突变情况在内的预后列线图,并证明该模型有助于GBM患者个体化生存评估和好转治疗策略。
3DNA甲基化构建脑胶质瘤预后模型
DNA甲基化是核酸的一种重要修饰,可调节基因的表达和控制,异常的DNA甲基化与许多疾病的发生发展机制有关,包括癌症、心血管疾病、代谢紊乱等。O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)可以修复烷化剂对染色体的致癌、致突变和细胞毒作用的损伤。
在正常情况下,MGMT对细胞起保护作用,但是在胶质瘤的化疗过程中,MGMT可以修复化疗药物对胶质瘤细胞产生的杀伤,从而降低化疗疗效。Gorlia等通过年龄、手术范围、简易精神状态评价评分、MGMT甲基化状态来构建接受替莫唑胺治疗的GBM患者的预后模型,用于评价影响GBM患者生存的相关因素。
4非编码RNA构建脑胶质瘤预后模型
非编码RNA主要包括长链非编码RNA、微小RNA和环状RNA等,其在脑胶质瘤组织与正常组织中存在差异性表达并发挥重要作用,可能成为未来新型疾病诊断标志物及疾病治疗的潜在靶点。有研究通过加权基因共表达网络分析和L1惩罚较小收缩选择算子Cox比例风险模型,识别用于评估GBM预后的长链非编码RNA(C20orf166-AS1、LINC00645、LBX2-AS1、LINC00565、LINC00641、PRRT3-AS1),风险评分结果将患者分为组和低风险组。
5其他因素构建脑胶质瘤预后模型
选择性剪接是产生多种蛋白质的主要驱动力,是真核细胞功能调控的基础。选择性剪接在胶质瘤的调节中起重要作用,Xie等从TCGA中获得与GBM相关的选择性剪接谱和临床生存数据并进行Cox回归分析,确定7个选择性剪接计算风险评分,构建GBM预后模型。一些以外周血炎症细胞为基础的评分,如中性粒细胞/淋巴细胞比值已被证实为各种类型肿瘤的预后标志,构建包括中性粒细胞/淋巴细胞比值评分的脑胶质瘤预后模型列线图后可更准确的评估患者预后。
Zhao等利用中国脑胶质瘤基因组图谱和TCGA数据研究结果表明,葡萄糖相关标志物风险评分较高的肿瘤可能与细胞周期有关,血糖浓度与脑胶质瘤的恶性程度及患者的生存率有关,并建立胶质瘤葡萄糖相关风险评估模型。PDI家族由21个成员组成,共享一个相同的结构域,许多研究已经将PDI与脑胶质瘤的增殖、侵袭和转移调控联系起来。
Peng等对PDI家族成员进行多方位分析,揭示了PDIs参与胶质瘤进展的几个新的潜在信号通路,基于PDIs的生存风险评分和其他临床因素建立了胶质瘤预后列线图。
- 文章标题:预后模型在脑胶质瘤疾病中的应用
- 更新时间:2021-11-10 15:37:56